Briefings in Bioinformatics | Protein-DNA binding sites prediction based on pre-trained protein language model and contrastive learning
ABSTRACT: Protein-DNA interaction is critical for life activities such as replication, transcription, and splicing. Identifying protein-DNA binding residues is essential for m…
eLife | H3-OPT: Accurate prediction of CDR-H3 loop structures of antibodies with deep learning
ABSTRACT: Accurate prediction of the structurally diverse complementarity determining region heavy chain 3 (CDR-H3) loop structure remains a primary and long-standing challeng…
Cell Reports Physical Science | Coupling of alkynes and aryl halides with nickel-catalyzed Sonogashira reactions
ABSTRACT: Methods for incorporating alkynes into molecular skeletons have been the subject of continued research. Compared to the cross-couplings used to form C–C(sp3) an…
首届AI药物研发算法大赛决赛在清华大学药学院成功举行
8月26日，首届AI药物研发算法大赛决赛在清华大学药学院成功举行。本次比赛由清华大学药学院、百度飞桨、百度智能云和临港实验室共同发起，并得到中国药学会等单位大力支持，同时邀请到多位制药领域专家担任专家委员会委员。 经过一上午的精彩答辩，来自微软亚洲研究院的ViSNet-Drug团队获得了一等奖，来自中国科学院上海药物研究所的蓝风信团队和来自上海交通…
博士生田阳荣获第九届中国国际互联网+大学生创新创业大赛北京赛区二等奖
清华大学田博学课题组博士生田阳团队介绍了使用计算化学、机器学习和专家系统开发的一种机会发现系统。该系统发现了多种超精细药物砌块，并且进行合成和产业化工作。 第九届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛北京赛区比赛由北京市教育委员会主办，是全市参赛面最广、覆盖高校最多、参赛水平最高、影响力最大的创新创业盛会，现已成为深化高校创新创业教育改革、促进高校…
本科生SRT项目荣获清华大学第41届“挑战杯”学生课外学术科技作品竞赛-基础科学赛道三等奖
田博学老师指导的本科生SRT项目《优化小分子药物ADMET性质的AI算法》在2023年4月获得清华大学第41届“挑战杯”学生课外学术科技作品竞赛-基础科学赛道三等奖。 团队成员：张梦遥 洪宇睿 廖艺臻 王珏 答辩现场-廖艺臻
博士生田阳参加第十届清华大学“校长杯”创新挑战赛荣获挑战奖
2023年4月30日，第十届清华大学“校长杯”创新挑战赛决赛在清华经管学院建华楼举行，取得圆满成功。经过激烈竞争，127支报名团队中的15支团队成功晋级决赛，他们在比拼中展示了出色的创新和创业潜力。 清华大学田博学课题组的博士生田阳领导的领海科技介绍了国家一类新兽药“海立停”的研发和产业化情况，该药物针对重大经济动物疫病主流性腹泻，通过精彩的展示和…
清华大学田博学团队参加DeeCamp2022人工智能训练营暨创新挑战赛荣获优胜奖
DeeCamp 人工智能训练营是创新工场发起的一项面向全球大学生的公益项目。2022年的主题是 “用 AI 探索生命科学新边界”，由创新工场和清华大学智能产业研究院（AIR）联合主办，来自全球各个地区顶尖高校的计算机、生命科学等专业的 150 位学员自发组成 30 支队伍。 田博学团队在DeeCamp2022…
Tetrahedron Chem | Nickel-catalyzed enantioselective domino Heck/Sonogashira coupling for construction of C(sp)-C(sp3) bond-substituted quaternary carbon centers
ABSTRACT: Enantioselective chemical transformations to introduce sp carbons and trifluoromethyl group into 3,3-disubstituted-2-oxindoles is among chemists' most wanted. We rep…
