PointGAT: A Quantum Chemical Property Prediction Model Integrating Graph Attention and 3D Geometry
ABSTRACT: Predicting quantum chemical properties is a fundamental challenge for computational chemistry. While the development of graph neural networks has advanced molecular …
Enhancing Protein Solubility via Glycosylation: From Chemical Synthesis to Machine Learning Predictions
ABSTRACT: Glycosylation is a valuable tool for modulating protein solubility; however, the lack of reliable research strategies has impeded efficient progress in understanding…
DeepP450: Predicting Human P450 Activities of Small Molecules by Integrating Pretrained Protein Language Model and Molecular Representation
ABSTRACT: Cytochrome P450 enzymes (CYPs) play a crucial role in Phase I drug metabolism in the human body, and CYP activity toward compounds can significantly affect druggabil…
博士生张蓉在2024年清华大学校园马拉松赛中荣获女子半程马拉松组第四名，在校生中排名女子组第一
2018级博士生张蓉在2024年清华大学校园马拉松赛中表现出色，以1小时44分22秒的成绩荣获女子半程马拉松组第四名，在校生中排名女子组第一，同时刷新了她的个人最佳成绩（此前PB 1:48:22）。在肩负着沉重的科研压力下，作为一名非体育特长生能够取得这样的成绩，实属难得。 张蓉同学表示：马拉松比赛靠的是坚强的毅力和坚定的信念，还有对于自我体能极限…
首届AI药物研发算法大赛决赛在清华大学药学院成功举行
8月26日，首届AI药物研发算法大赛决赛在清华大学药学院成功举行。本次比赛由清华大学药学院、百度飞桨、百度智能云和临港实验室共同发起，并得到中国药学会等单位大力支持，同时邀请到多位制药领域专家担任专家委员会委员。 经过一上午的精彩答辩，来自微软亚洲研究院的ViSNet-Drug团队获得了一等奖，来自中国科学院上海药物研究所的蓝风信团队和来自上海交通…
H3-OPT: Accurate prediction of CDR-H3 loop structures of antibodies with deep learning
ABSTRACT: Accurate prediction of the structurally diverse complementarity determining region heavy chain 3 (CDR-H3) loop structure remains a primary and long-standing challeng…
博士生田阳荣获第九届中国国际互联网+大学生创新创业大赛北京赛区二等奖
清华大学田博学课题组博士生田阳团队介绍了使用计算化学、机器学习和专家系统开发的一种机会发现系统。该系统发现了多种超精细药物砌块，并且进行合成和产业化工作。 第九届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛北京赛区比赛由北京市教育委员会主办，是全市参赛面最广、覆盖高校最多、参赛水平最高、影响力最大的创新创业盛会，现已成为深化高校创新创业教育改革、促进高校…
Protein-DNA binding sites prediction based on pre-trained protein language model and contrastive learning
ABSTRACT: Protein-DNA interaction is critical for life activities such as replication, transcription, and splicing. Identifying protein-DNA binding residues is essential for m…
本科生SRT项目荣获清华大学第41届“挑战杯”学生课外学术科技作品竞赛-基础科学赛道三等奖
田博学老师指导的本科生SRT项目《优化小分子药物ADMET性质的AI算法》在2023年4月获得清华大学第41届“挑战杯”学生课外学术科技作品竞赛-基础科学赛道三等奖。 团队成员：张梦遥 洪宇睿 廖艺臻 王珏 答辩现场-廖艺臻
博士生田阳参加第十届清华大学“校长杯”创新挑战赛荣获挑战奖
2023年4月30日，第十届清华大学“校长杯”创新挑战赛决赛在清华经管学院建华楼举行，取得圆满成功。经过激烈竞争，127支报名团队中的15支团队成功晋级决赛，他们在比拼中展示了出色的创新和创业潜力。 清华大学田博学课题组的博士生田阳领导的领海科技介绍了国家一类新兽药“海立停”的研发和产业化情况，该药物针对重大经济动物疫病主流性腹泻，通过精彩的展示和…
